Pruebas de identidad y paternidad en ganado Brahman registrado de Costa Rica
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Date
2018Author
Campos, Jorge
Camacho, Jorge
Cruz, Argerie
Vargas Leitón, Bernardo
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Show full item recordAbstract
En programas de evaluación genética es
indispensable la correcta identificación de los
individuos de la población y la certeza de sus
relaciones de parentesco. El objetivo de este
estudio fue implementar pruebas de identificación y verificación de paternidad mediante 18
marcadores microsatélite en ganado registrado
de raza Brahman de Costa Rica. Inicialmente, se
calcularon parámetros genéticos poblacionales a
partir del análisis de 950 muestras de ADN (7
sementales, 788 vacas y 155 crías) colectadas
durante los años 2015/2016, procedentes de 13
hatos de ganado registrado. Los promedios de
heterocigosidad observada y esperada fueron
de 0,67 y 0,70, respectivamente. El índice de
fijación fue de 4%, con desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg (EHW) en
9 de los 18 loci. Todos los marcadores, excepto
ETH225, presentaron contenido de información
polimórfica mayor a 0,50. La probabilidad de
identidad combinada con todos los marcadores
fue 2,4×10-17 para individuos seleccionados aleatoriamente y 2,6×10-7 para hermanos completos. Las probabilidades de exclusión combinada
fueron superiores a 0,999. Todos estos parámetros presentaron valores satisfactorios para la realización de pruebas de identidad y paternidad.
Seguidamente, se realizaron pruebas de confirmación de paternidad en 137 crías con padre y/o
madre reportados procedentes de 3 hatos. Los
porcentajes de rechazo de paternidad basados
en el principio de exclusión (al menos 2 loci discordantes) vs. índices críticos de verosimilitud,
fueron respectivamente: 18,2% vs. 24,1% para las
madres, 14,0% vs. 12,5% para los padres, y 34,6%
vs. 26,3% para los tríos. Se observaron diferencias significativas entre hatos para el porcentaje
de rechazo de paternidad, oscilando desde 15,6
a 39,4% en madres, 0 a 30% en padres, y 19,5 a
31,8% en tríos. Se demuestra la necesidad de un
mayor control en los apareamientos y en el registro de información genealógica en estos hatos. In genetic evaluation programs, the correct
identification of the individuals of the population
and the certainty of their kinship relationships
is indispensable. The objective of this study
was to implement identity verification and
paternity tests using 18 microsatellite markers,
in registered Brahman cattle from Costa Rica.
Genetic parameters were calculated from the
analysis of 950 DNA samples (7 sires, 788
cows and 155 offspring) collected during years
2015/2016, from 13 herds with registered cattle.
Average observed and expected heterozygosity
were 0.67 and 0.70, respectively. The fixation
index was 4%, with significant deviations of the
Hardy Weinberg equilibrium in 9 of the 18 loci.
All markers except ETH225 had polymorphic
information content greater than 0.50. The
combined probability of identity with all markers
was 2.4×10-17 for randomly selected individuals
and 2.6×10-7 for full siblings. The combined
probabilities of exclusion were greater than
0.999. All these parameters presented satisfactory
values for the accomplishment of tests of identity
and paternity. Next, paternity confirmation tests were performed on 137 offspring with reported
father and/or mother from 3 herds. Paternity
rejection rates based on the exclusion principle
(at least 2 discordant loci) vs. critical likelihood
values were, respectively: 18.2% vs. 24.1%
for mothers, 14.0% vs. 12.5% for fathers, and
34.6% vs. 26.3% for trios. There were significant
differences between herds for the percentage of
paternity rejection, ranging from 15.6 to 39.4% in
mothers, 0 to 30% in fathers, and 19.5 to 31.8% in
trios. The need for greater control in mating and
recording of genealogical information in these
herds is demonstrated.
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- Artículos Científicos [598]
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