Antifungal susceptibility of Aspergillus spp. isolated from coffee beans of Los Santos Coffee Region, Costa Rica

Abstract

The indiscriminate use of fungicides in agricultural crops is considered one of the most important causes of antifungal resistance. Hence, it is our interest to contribute to the knowledge of antifungal resistance, within the framework of One Health. The results will be useful to define appropriate policies in the use of these drugs both in the clinical area and in agriculture. Thus, the susceptibility patterns of 187 Aspergillus spp. (A. flavus [n = 46], A. fumigatus [n = 8], A. insuetus [n = 1]; A. niger [n = 85], A. tamarii [n = 34] and Aspergillus section Versicolores [n = 13]), isolated from coffee beans from the Los Santos coffee-growing region in Costa Rica, were evaluated for amphotericin B (AMB), itraconazole (ITZ) and voriconazole (VRC); using the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) broth microdilution M38 guideline. The mean minimal inhibitory concentration (MIC) for AMB was 2.77 ± 3.19 μg mL−1, 0.29 ± 0.26 μg mL−1 for ITZ, and 1.14 ± 2.68 μg mL−1 for VRZ. Based on the CLSI guidelines, 15.2% of A. flavus, 75.0% of A. fumigatus and 3.5% of the A. niger were classified as non-wild type for AMB; 4.3% of the A. flavus/oryzae and 25.0% of the A. fumigatus were classified as non-wild type for VRC. ITZ presented the lowest MIC distribution, and the isolates were classified as wild-type strains. The results show a high susceptibility to ITZ, moderate to VRC (treatment of choice for invasive aspergillosis) and low susceptibility to AMB.

El uso indiscriminado de fungicidas en los cultivos agrícolas se considera una de las causas más importantes de la resistencia a los antifúngicos. Por ello, nuestro interés radica en contribuir al conocimiento de la resistencia a los antifúngicos, en el marco del enfoque «One Health». Los resultados serán útiles para definir políticas adecuadas en el uso de estos fármacos, tanto en el ámbito clínico como en la agricultura. Así, se determinaron los patrones de sensibilidad de 187 cepas de Aspergillus spp. (A. flavus [n = 46], A. fumigatus [n = 8], A. insuetus [n = 1]; A. niger [n = 85], A. tamarii [n = 34] y Aspergillus sección Versicolores [n = 13]), aisladas de granos de café de la región cafetera de Los Santos en Costa Rica, se evaluaron para la anfotericina B (AMB), itraconazol (ITZ) y voriconazol (VRC), siguiendo la guía M38 de microdilución en caldo del Instituto de Normas Clínicas y de Laboratorio (CLSI). La concentración mínima inhibitoria (CMI) media para la AMB fue de 2,77 ± 3,19 μg/mL, 0,29 ± 0,26 μg/mL para el ITZ y 1,14 ± 2,68 μg/mL para el VRZ. Según las directrices del CLSI, el 15,2 % de A. flavus, el 75,0 % de A. fumigatus y el 3,5 % de A. niger se clasificaron como no de tipo salvaje para AMB; el 4,3 % de A. flavus/oryzae y el 25,0 % de A. fumigatus se clasificaron como no de tipo salvaje para VRC. La ITZ presentó la distribución de CMI más baja, y las cepas se clasificaron como cepas de tipo salvaje. Los resultados muestran una alta sensibilidad a la ITZ, una sensibilidad moderada a la VRC (tratamiento de elección para la aspergilosis invasiva) y una baja sensibilidad a la AMB.