Diversity of Human Rotavirus G and P Genotypes in Panama, Costa Rica, and the Dominican Republic

Abstract

In this study 2,089 fecal samples from patients with gastroenteritis were analyzed from different hospitals in Panama, Costa Rica, and the Dominican Republic during the period comprised between December 2002 and July 2003. One hundred samples per country from the positives to the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) kit were analyzed by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) to determine the G and P genotypes: in Panama, Costa Rica, and Dominican Republic the combinations G and P have a great diversity and unusual genotypes. These results highlight an unexpected diversity among rotavirus strains in these countries and emphasize the need for further serologic and genetic surveys on more rotavirus strains in Central America and the Caribbean. In this context, the next generation of rotavirus vaccines will need to provide adequate protection against diseases caused by unusual genotypes. These results represent the second report of rotavirus genotypes in Costa Rica and first-time reports of rotavirus genotypes in Panama and the Dominican Republic.En este estudio se analizaron 2.089 muestras fecales de pacientes con gastroenteritis procedentes de diferentes hospitales de Panamá, Costa Rica y la República Dominicana durante el período comprendido entre diciembre de 2002 y julio de 2003. Cien muestras por país de los positivos al kit de ensayo inmunoenzimático (ELISA) se analizaron mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) para determinar los genotipos G y P: en Panamá, Costa Rica y República Dominicana las combinaciones G y P presentan una gran diversidad y genotipos inusuales. Estos resultados ponen de manifiesto una diversidad inesperada entre las cepas de rotavirus en estos países y subrayan la necesidad de realizar más estudios serológicos y genéticos sobre más cepas de rotavirus en América Central y el Caribe. En este contexto, la próxima generación de vacunas contra el rotavirus tendrá que proporcionar una protección adecuada contra las enfermedades causadas por genotipos inusuales. Estos resultados representan el segundo informe de genotipos de rotavirus en Costa Rica y los primeros informes de genotipos de rotavirus en Panamá y la República Dominicana.