Preservación de la diversidad de Rubus en fincas productoras de mora en Costa Rica

Abstract

El presente estudio analiza la diversidad del género Rubus en Costa Rica, con énfasis en moras cultivadas y nativas de fincas agrícolas del Valle Central y Pérez Zeledón. Su objetivo es contribuir a la conservación de la diversidad genética mediante la creación y preservación de ejemplares de herbario, complementadas con análisis moleculares y morfológicos. Los ejemplares fueron procesados mediante técnicas de prensado, secado y cuarentena para su incorporación a herbarios nacionales. Asimismo, se realizaron análisis genéticos mediante secuenciación de Sanger, PCR y marcadores plastidiales (matK, rpoC1 y trnH-psbA), además de un análisis de componentes principales basado en características morfológicas y morfométricas. Se identificaron 11 especies de Rubus de las 14 reportadas para Costa Rica, incluyendo especies nativas e introducidas. Los marcadores moleculares permitieron establecer relaciones filogenéticas, mientras que el análisis de componentes principales evidenció una elevada variabilidad morfológica y la complejidad taxonómica del género. También se detectó una posible confusión entre Rubus miser y Rubus adenotrichos, lo que resalta la necesidad de una revisión taxonómica precisa. Los resultados demuestran que las fincas productoras de mora constituyen importantes reservorios de diversidad genética. La integración de herramientas taxonómicas, morfológicas y moleculares representa una estrategia eficaz para la identificación y conservación de especies, así como para su aprovechamiento sostenible y potencial aplicación en programas de mejoramiento genético en Costa Rica.

This study examines the diversity of the genus *Rubus* in Costa Rica, focusing on cultivated and native blackberries from agricultural farms in the Central Valley and Pérez Zeledón. Its main objective is to contribute to the conservation of genetic diversity through the collection and preservation of herbarium specimens, complemented by molecular and morphological analyses. Plant material was pressed, dried, and quarantined prior to its incorporation into national herbaria. Genetic analyses were also conducted using Sanger sequencing, PCR, and plastid markers (*matK*, *rpoC1*, and *trnH-psbA*), together with a principal component analysis based on morphological and morphometric characteristics. A total of 11 *Rubus* species were identified out of the 14 species previously reported for Costa Rica, including both native and introduced species. Molecular markers allowed the establishment of clear phylogenetic relationships, while principal component analysis revealed high morphological variability and the taxonomic complexity of the genus. A possible taxonomic confusion between *Rubus miser* and *Rubus adenotrichos* was also identified, highlighting the need for accurate taxonomic revision. The findings demonstrate that blackberry-producing farms constitute important reservoirs of *Rubus* genetic diversity. The integration of taxonomic, morphological, and molecular approaches provides an effective strategy for species identification and conservation, as well as for the sustainable use of these genetic resources and their potential application in breeding programs in Costa Rica.