An environmental niche model to estimate the potential presence of venezuelan equine encephalitis virus in Costa Rica
Fecha
2020-12-30
Autores
León, Bernal
Jiménez-Sánchez, Carlos
Retamosa Izaguirre, Mónica
Título de la revista
ISSN de la revista
Título del volumen
Editor
International Journal of Environmental Research and Public Health
Resumen
Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) is an arbovirus transmitted by arthropods,
widely distributed in the Americas that, depending on the subtype, can produce outbreaks or yearly
cases of encephalitis in horses and humans. The symptoms are similar to those caused by dengue
virus and in the worst-case scenario, involve encephalitis, and death. MaxEnt is software that
uses climatological, geographical, and occurrence data of a particular species to create a model to
estimate possible niches that could have these favorable conditions. We used MaxEnt with a total of
188 registers of VEEV presence, and 20 variables, (19 bioclimatological plus altitude) to determine
the niches promising for the presence of VEEV. The area under the ROC curve (AUC) value for the
model with all variables was 0.80 for the training data and 0.72 for the test. The variables with the
highest contribution to the model were Bio11 (mean temperature of the coldest quarter) 32.5%, Bio17
(precipitation of the driest quarter) 16.9%, Bio2 (annual mean temperature) 15.1%, altitude (m.a.s.l)
6.6%, and Bio18 (precipitation of the warmest quarter) 6.2%. The product of this research will be
useful under the one health scheme to animal and human health authorities to forecast areas with
high propensity for VEEV cases in the future.
El virus de la encefalitis equina venezolana (VEEV) es un arbovirus transmitido por artrópodos, ampliamente distribuido en las Américas que, dependiendo del subtipo, puede producir brotes o casos anuales de encefalitis en caballos y humanos. Los síntomas son similares a los causados por el virus del dengue y, en el peor de los casos, involucran encefalitis y muerte. MaxEnt es un software que utiliza datos climatológicos, geográficos y de ocurrencia de una especie en particular para crear un modelo para estimar posibles nichos que podrían tener estas condiciones favorables. Utilizamos MaxEnt con un total de 188 registros de presencia de VEEV y 20 variables (19 bioclimatológicas más altitud) para determinar los nichos prometedores para la presencia de VEEV. El área bajo el valor de la curva ROC (AUC) para el modelo con todas las variables fue 0,80 para los datos de entrenamiento y 0,72 para la prueba. Las variables con mayor aporte al modelo fueron Bio11 (temperatura media del trimestre más frío) 32,5%, Bio17 (precipitación del trimestre más seco) 16,9%, Bio2 (temperatura media anual) 15,1%, altitud (msnm) 6,6% y Bio18 (precipitación del trimestre más cálido) 6,2%. El producto de esta investigación será útil bajo el esquema de salud única para las autoridades de salud animal y humana para pronosticar áreas con alta propensión a casos de VEEV en el futuro.
El virus de la encefalitis equina venezolana (VEEV) es un arbovirus transmitido por artrópodos, ampliamente distribuido en las Américas que, dependiendo del subtipo, puede producir brotes o casos anuales de encefalitis en caballos y humanos. Los síntomas son similares a los causados por el virus del dengue y, en el peor de los casos, involucran encefalitis y muerte. MaxEnt es un software que utiliza datos climatológicos, geográficos y de ocurrencia de una especie en particular para crear un modelo para estimar posibles nichos que podrían tener estas condiciones favorables. Utilizamos MaxEnt con un total de 188 registros de presencia de VEEV y 20 variables (19 bioclimatológicas más altitud) para determinar los nichos prometedores para la presencia de VEEV. El área bajo el valor de la curva ROC (AUC) para el modelo con todas las variables fue 0,80 para los datos de entrenamiento y 0,72 para la prueba. Las variables con mayor aporte al modelo fueron Bio11 (temperatura media del trimestre más frío) 32,5%, Bio17 (precipitación del trimestre más seco) 16,9%, Bio2 (temperatura media anual) 15,1%, altitud (msnm) 6,6% y Bio18 (precipitación del trimestre más cálido) 6,2%. El producto de esta investigación será útil bajo el esquema de salud única para las autoridades de salud animal y humana para pronosticar áreas con alta propensión a casos de VEEV en el futuro.
Descripción
Palabras clave
COSTA RICA, CABALLOS, VIROLOGIA VETERINARIA, VETERINARY VIROLOGY, EQUINOS, ENCEFALITIS, ENCEPHALITIS