Molecular typing of bovine papillomaviruses in Costa Rica

Abstract

Bovine papillomaviruses are related to cause fbroepithelial proliferations in the skin and mucosae and are associated with economic loss mainly related to poor body condition and reduced milk production. This study aimed to investigate the presence and types of bovine papillomaviruses (BPVs) in cattle sampled in diferent areas of Costa Rica using molecular techniques. A descriptive study with a non-probability convenience sampling was carried out. A total of 99 papillomatous lesions were collected from 63 animals in 32 farms, and analyzed by polymerase chain reaction, rolling circle amplifcation (RCA), sequencing, and restriction enzymes digestion. Seven bovine papillomavirus types (BPV1, BPV2, BPV4, BPV6, BPV7, BPV10, BPV11) and two putative novel viral variants (BPV-CR1 and BPV-CR2) were identifed for the frst time in Costa Rica. BPV6 was the most frequently detected virus in lesions (31.2%), followed by BPV2 (25%) and BPV1 (25%). BPV1 and BPV2 were the most widely distributed in the Country. Coinfections were recorded in two animals (BPV1 / BPV2 and BPV4 / BPV6). Restriction analyses allowed diferentiating BPV1 from BPV2, BPV4, and BPV7, but failed to identify BPV6, BPV10, and BPV11. Results suggest that a great PVs diversity is harbored by bovines in Costa Rica and indicate the need for further investigations aimed to uncover PV diversity at the full genomic level.Los papilomavirus bovinos están relacionados con la causa de proliferaciones fbroepiteliales en la piel y las mucosas y están asociados con pérdidas económicas relacionadas principalmente con la mala condición corporal y la reducción de la producción de leche. Este estudio tiene como objetivo investigar la presencia y tipos de papilomavirus bovino (VPB) en bovinos muestreados en diferentes zonas de Costa Rica mediante técnicas moleculares. molecular. Se realizó un estudio descriptivo con un muestreo no probabilístico de conveniencia. Se recogieron 99 lesiones papilomatosas de papiloma en 63 animales de 32 fincas, y se analizaron mediante reacción en cadena de la polimerasa, amplificación en círculo rodante (RCA), secuenciación y digestión con enzimas de restricción. Siete tipos de papilomavirus bovinos (BPV1, BPV2, BPV4, BPV6, BPV7, BPV10, BPV11) y dos nuevas variantes virales putativas (BPV-CR1 y BPV-CR2) fueron identificadas por primera vez en Costa Rica. El BPV6 fue el virus más frecuentemente detectado en las lesiones (31,2%), seguido del BPV2 (25%) y del BPV1 (25%). El BPV1 y el BPV2 fueron los más distribuidos en el país. Se registraron coinfecciones en dos animales (BPV1 / BPV2 y BPV4 / BPV6). Los análisis de restricción permitieron diferenciar el BPV1 del BPV2, el BPV4 y el BPV7, pero no identificaron BPV6, BPV10 y BPV11. Los resultados sugieren que los bovinos de Costa Rica albergan una gran diversidad de PVs e indican la necesidad de necesidad de realizar más investigaciones para descubrir la diversidad de PVs a nivel genómico completo.