Facultad de Ciencias de la Tierra y el Mar

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La Facultad de Ciencias de la Tierra y Mar (FCTM) de la Universidad Nacional (UNA), se crea en el año 1973 y desde sus inicios se ha caracterizado por su compromiso con los principios y valores que sustentan la Universidad Necesaria; la cual en lo fundamental se caracteriza por la búsqueda de nuevos espacios que le permitan seguir aportando a la sociedad profesionales y productos de la investigación, extensión y servicios que contribuyan a la mejora en la calidad de vida de la población costarricense y sus relaciones con la naturaleza.

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Almácigos de café producidos en tubetes con diferentes sustratos en Sabanilla de Alajuela, Costa Rica
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-06-30) Chaves Vargas, Hugo; Sancho Barrantes, Ellen; Peraza-Padilla, Walter
Un factor clave en la producción de almácigos es garantizar un sustrato que cumpla con los requisitos de textura, estructura, fertilidad y una buena sanidad, a fin de conseguir plantas sanas, vigorosas y con buen desarrollo para la etapa de campo. Una práctica para obtener almácigo a menor costo y con ciertas características, es la técnica de almácigo en tubete. El objetivo de este estudio fue evaluar variables de crecimiento, costo económico y mortalidad de un almácigo de café producido mediante tubetes en tres diferentes sustratos. El ensayo se llevó a cabo en la localidad de El Cerro, Sabanilla de Alajuela durante los meses de abril a septiembre del 2015. Se utilizó un diseño de bloques completos al azar con cinco repeticiones y tres tratamientos (T), que correspondieron a los sustratos: T1: Peat Moss, T2: suelo + broza de café y T3: suelo + súper tierra + fibra de coco. Las variables de crecimiento analizadas (altura, diámetro del tallo y pares de hojas) presentaron diferencias significativas mediante la prueba estadística LSD Fisher (>0.05); para todas las variables, el comportamiento fue T1>T2>T3. No hubo pérdidas en plantas para los tres tratamientos, por lo que el porcentaje de mortalidad se mantuvo en cero. No se determinó ninguna diferencia en cuanto a los sustratos, por lo que cualquiera de ellos, puede ser empleado para la elaboración de almácigos tanto por los materiales utilizados así como por el costo de elaboración, el cual en todos los casos es menor al costo promedio de elaboración con otras técnicas. La decisión de cuál de ellos utilizar, dependerá del criterio y la capacidad del productor.
Benchmarking AI-based Plasmid Annotation Tools for Antibiotic Resistance Genes Mining From Metagenome of the Virilla River, Costa Rica
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2023-11-28) Rojas-Villalta, Dorian; Calderón-Osorno, Melany; Barrantes, Kenia; Arias-Andres, Maria; Rojas-Jiménez, Keilor
Bioinformatics and Artificial Intelligence (AI) stand as rapidly evolving tools that have facilitated the annotation of mobile genetic elements (MGEs), enabling the prediction of health risk factors in polluted environments, such as antibiotic resistance genes (ARGs). This study aims to assess the performance of four AI-based plasmid annotation tools (Plasflow, Platon, RFPlasmid, and PlasForest) by employing defined performance parameters for the identification of ARGs in the metagenome of one sediment sample obtained from the Virilla River, Costa Rica. We extracted and sequenced complete DNA from the sample, assembled the metagenome, and then performed the plasmid prediction with each bioinformatic tool, and the ARGs annotation using the Resistance Gene Identifier web portal. Sensitivity, specificity, precision, negative predictive value, accuracy, and F1-score were calculated for each ARGs prediction result of the evaluated plasmidomes. Notably, Platon emerged as the highest performer among the assessed tools, exhibiting exceptional scores. Conversely, Plasflow seems to face difficulties distinguishing between chromosomal and plasmid sequences, while PlasForest has encountered limitations when handling small contigs. RFPlasmid displayed diminished specificity and was outperformed by its taxon-dependent workflow. We recommend the adoption of Platon as the preferred bioinformatic tool for resistome investigations in the taxon-independent environmental metagenomic domain. Meanwhile, RFPlasmid presents a compelling choice for taxon-dependent prediction due to its exclusive incorporation of this approach. We expect that the results of this study serve as a guiding resource in selecting AI-based tools for accurately predicting the plasmidome and its associated genes.
Evaluación de propiedades fisicoquímicas del frijol costarricense (Phaseolus vulgaris) como estrategia de diferenciación y valorización
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-07-30) Mencía Guevara, Alejandra; Villalobos Moya, Keylor H.; Rubí Zeledón, Julián; Granados Rojas, Leonardo; Hernández Aguirre, Carlos; Brenes Monge, Hillary
Debido a los cambios en patrones de consumo orientados a reconocer atributos de productos locales y diferenciados, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar variedades de frijol costarricense con la finalidad de identificar sus propiedades que permitan una mejor valoración y diferenciación dentro del mercado nacional. Se realizó un análisis proximal, fenólico, físico y de calidad e impurezas. Los análisis fueron realizados en el año 2018 en laboratorios de la Universidad Nacional, Costa Rica y el Laboratorio de Calidad e Inocuidad del Consejo Nacional de Producción (CNP). Entre los resultados obtenidos sobresalió la variedad Guaimí (proveniente de Upala) la cual presentó menor dureza, por tanto, podría necesitar menor tiempo de cocción para alcanzar la textura óptima, así como conservar mejor valor textural como sus propiedades funcionales. De forma general, se obtuvo valores relevantes de proteína en rangos de 16 a 27%, de fibra de 3 a 7%, de extracto etéreo de 3 a 7% y de cenizas de 4 a 6%. Los resultados del estudio podrían ser un punto de partida para definir la funcionalidad de cada variedad de frijol de acuerdo a sus propiedades físicas y químicas.
Evaluación in vitro de hongos nematófagos contra el nematodo barrenador Radopholus similis (Cobb, 1893) Thorne, 1949 en Costa Rica
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2023) Ugalde, Berlioth; Artavia Carmona, Roy; Vargas Martínez, Alejandro; Peraza-Padilla, Walter
El objetivo fue evaluar la capacidad nematicida in vitro de hongos nematófagos (HN) de plantaciones de banano de la región Huetar Atlántica contra el nematodo Radopholus similis. Previamente identificados los HN, se utilizaron dos aislamientos de Fusarium oxysporum (Fox2 y Fox3), dos aislamientos de Trichoderma asperellum (Trich1 y Trich3) y un aislamiento de Purpureocillium lilacinum (Pli) para evaluar in vitro su patogenicidad contra R. similis. Se realizó una suspensión y conteo de esporas de cada hongo para determinar la concentración de conidios (UFC/ml) a depositar por plato Petri. Posteriormente se depositó por plato 0,5 ml de una suspensión que contenía 60 adultos y juveniles de la especie R. similis y se realizó el conteo de nematodos a las 24h y 42h y se verificó la capacidad depredadora de cada aislamiento. Se realizó un análisis estadístico ANOVA y comparaciones de medias con el programa estadístico InfoStat para evaluar el efecto de los tratamientos en la mortalidad de R. similis. A las 24 horas después de la inoculación, no se observaron diferencias significativas entre los tratamientos, con un promedio de mortalidad del 15-30%. Sin embargo, a las 42 horas, se identificaron diferencias significativas en la capacidad antagónica de los aislamientos Trich3, Fox3, Fox2 y Trich1, con porcentajes de mortalidad del 53.3%, 41.6%, 37.9% y 37.7% respectivamente. El aislamiento Pli (25.8%) no mostró diferencias significativas en comparación con el control (Tx1). Los aislamientos de T. asperellum y F. oxysporum poseen una alta capacidad nematófaga contra el nematodo barrenador R. similis con potencial para ser utilizados como agentes de control biológico.
Fortalecimiento de capacidades para el autoconsumo en comunidades rurales: La experiencia de un proyecto de extensión de la Universidad Nacional, Costa Rica.
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-06-30) Daly Duarte, Carmen ; Rojas Hidalgo, Ingrid; ÁLAVEZ- LÓPEZ, SERGIO; Mena García, Priscila
En la Universidad Nacional de Costa Rica existen diversos proyectos de extensión los cuales buscan generar una relación entre la sociedad y la universidad, para contribuir al desarrollo conjunto de las comunidades. Este es el caso del proyecto denominado: “Gestión del Desarrollo Rural Territorial en tres comunidades del Cantón de Sarapiquí”, que tuvo vigencia desde el 2018 y hasta el 2020. Las comunidades que integraron el proceso fueron El Roble de La Virgen, Cureña y La Rambla, las cuales poseen características de ruralidad, bajos índices de desarrollo social, y diversas condiciones climáticas, contextos que fueron abordados para el desarrollo de capacidades. Este artículo integra los ejes de seguridad/soberanía alimentaria y el de fortalecimiento de capacidades locales, por medio de una serie de capacitaciones en pro del mejoramiento de capacidades de autoconsumo en el área de jardines comestibles. Los talleres ejecutados dieron como resultado, que las personas participantes aprendieron sobre la necesidad de realizar ciertos cambios en sus hábitos, esto pudo ser constatado a través de un instrumento aplicado para conocer las costumbres de los protagonistas, donde la mayoría de las participantes fueron mujeres, quienes mencionaron que compraban sus vegetales en las verdulerías locales y estaban dispuestas a aprender cómo producir sus propios productos en sus casas, con el mejoramiento desde el punto de vista socioeconómico ambiental que esto puede significar. Los productos que indican como los más gustados son lechuga verde, chiles dulces, culantro castilla, remolacha, apio y cebollinos. Se logró crear un espacio de fortalecimiento de capacidades, con los conocidos Jardines Comestibles, los cuales permitieron reutilizar materiales que de otra forma serían desechos, pueden servir como terapia alternativa, les ayudan a las personas a tener acceso a algunos de sus alimentos de manera sana y limpia. Desde la Universidad, se tiene la responsabilidad de ser facilitadores de procesos, como parte del quehacer académico, contribuir con el fortalecimiento de las capacidades comunales, considerando el entorno y los saberes locales, adaptando las metodologías a las diferentes necesidades para un abordaje comunitario enfocado en acciones participativas.
Inventario de oferta de bienes y servicios articulables para impulsar la estrategia OVOP-Dota, Costa Rica
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-12-30) Villalobos Moya, Keylor; Sancho Rodríguez, Priscilla; Rubí Zeledón, Julián; Granados Rojas, Leonardo; Avendano Leadem, Daniel Francisco
En los últimos años, el movimiento OVOP ha crecido notablemente en Costa Rica como resultado de una iniciativa de instituciones del sector público en colaboración con organismos internacionales de cooperación con la finalidad es promover el desarrollo económico y la identidad local, mediante la generación y encadenamiento de capacidades comunitarias, emprendedoras y empresariales sustentadas en el potencial de los recursos locales. El éxito de una estrategia OVOP requiere disponer de información sistematizada de la oferta de productos y servicios disponibles en la comunidad, como base para la toma de decisiones y para la gestión de los procesos de organización comunitaria y empresarial local. Debido a que, el Cantón de Dota, uno de los territorios OVOP de Costa Rica, no disponía de información con el grado de sistematización necesario, se realizó un diagnóstico para la caracterización de emprendimientos en los principales distritos del Cantón. La información fue recolectada mediante fuente primaria, específicamente aplicación de encuestas, llamadas telefónicas y fuente secundaria (bases de datos de la Municipalidad de Dota). El estudio fue realizado durante el periodo de 2018 a 2020. Los resultados mostraron que la mayor cantidad de emprendimientos se agrupan en la categoría de producción alimentaria, seguida de las categorías de artesanías y hospedaje. Se aplicó un análisis de frecuencia de las empresas por distrito en el cual se determinó que Santa María es el que presenta la mayor concentración de emprendimientos.
Programa de compras institucionales en Costa Rica: Política productiva cuestionada pero socialmente necesaria
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-12-30) Cartín-Rojas, Andrés; Diaz Porras, Rafael A.; Alvarado Ruiz, José Mario
El PAI es un programa orientado a crear un mercado para pequeños productores agrícolas a través de las compras de instituciones estatales que asimismo se inscribe en las políticas públicas, para el fortalecimiento de la Seguridad Alimentaria y Nutricional (SAN). El análisis se realiza mediante el repaso de los argumentos que justifican la intervención del Estado, los objetivos que persigue y las fallas de la ejecución de la política. El PAI es una política deseable socialmente, para promover la producción de pequeños productores y a través de ello apoyar el desarrollo rural y la seguridad alimentaria, pero que, por su propia naturaleza, es un programa que involucra grados de dificultad altos al ser simultáneamente, instrumento de promoción productiva y de abastecimiento institucional. El artículo analiza en forma multifacética el PAI, y sobre la base del análisis específico de su gestión de inocuidad en la provisión de productos hortícolas, con especial atención a la gestión de inocuidad, determina puntos críticos del sistema, para su mejoramiento. Se concluye argumentando que la alternativa de utilizar mecanismos de mercado podría satisfacer los requerimientos de los clientes institucionales, pero no garantizaría la participación de pequeños productores. Por lo cual es fundamental afrontar los puntos críticos que enfrenta el programa.
Situación socioeconómica y productiva de sistemas caprinos en la Región Huetar Norte, Costa Rica
(Universidad Nacional, Costa Rica, 2020-07-30) Barboza Mora, Mauricio Alberto; Camacho Cascante , Maria Isabel ; Miranda, Omar; Porras Solís, Ángel Jesús
El estudio se realizó de febrero a junio del 2016, en la región Huetar Norte de Costa Rica. El objetivo fue mostrar resultados generales de la situación productiva y socioeconómica de los sistemas de producción caprina de la región. Se utilizó la base de datos del VI Censo Nacional Agropecuario (CENAGRO 2014) y una herramienta (encuesta) aplicada a socios activos de Coopecaprina R.L. Se utilizaron 15 variables (11 cualitativas y 4 cuantitativas). Se determinó mediante estadística descriptiva (por medio del software estadístico PSPPIRE (PSPP+GUI)), la distribución absoluta y porcentual para variables cualitativas, y los resultados de tendencia central y dispersión, para variables cuantitativas. En general, el 52% de los asociados a Coopecaprina R.L., poseen entre 1 a 40 animales en sistemas estabulados y destinan su producción al mercado local y la venta en finca. El 50% de estos sistemas son liderados por hombres con escolaridad primaria y trabajan internamente en la finca. En la región Huetar Norte, el 94% de las fincas posee menos de 20 animales y se mantienen en sistemas de pastoreo basados en pasturas naturales, y destinan la producción a la venta en finca. El 54% de estos sistemas son dirigidos por hombres que poseen primaria, no se asocian en organizaciones y laboran sin pago en sus fincas.

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